Pemetaan Epitranskriptomik m6A dalam Kanker Prostat

Studi terbaru dari Princess Margaret Cancer Center mengidentifikasi m6A sebagai modifikasi RNA kritis dalam kanker prostat. m6A berperan sebagai biomarker dan target terapeutik, memengaruhi prognosis. Penelitian ini menemukan lebih dari 32,000 situs m6A serta interaksi antara genetik dan mikroenvironment kanker. Temuan ini membuka kemungkinan baru dalam pengobatan kanker prostat yang agresif.

Penelitian terbaru mengenai kanker prostat mengungkapkan peran penting N6-methyladenosine (m6A) sebagai modifikasi RNA yang memengaruhi perilaku RNA dan merupakan penanda prognostik kanker. Peneliti dari Princess Margaret Cancer Center dan University of Toronto berhasil memetakan lanskap epitranskriptomik m6A di tumor prostat secara rinci, menyoroti interaksi antara genetik, mutasi tumor, dan mikroenvironment kanker. Temuan ini terbit di Nature Genetics.

Kanker prostat adalah penyakit yang tidak hanya ditentukan oleh mutasi DNA tetapi juga oleh modifikasi kimia RNA seperti m6A. Modifikasi ini mengontrol berbagai aspek kehidupan RNA dan dianggap sebagai pengatur penting dalam perkembangan kanker. Pola m6A yang teralterasi dan mutasi pada enzim pengatur m6A terkait dengan fenotip kanker.

Dalam penelitian, lebih dari 32,000 situs m6A diidentifikasi di 9,571 gen pada tumor prostat primer. Onkogen seperti MYC dan AR menunjukkan modifikasi m6A yang tinggi, sementara penekan tumor seperti TP53 menunjukkan modifikasi minimal. Penelitian ini membagi pasien menjadi lima subtipe m6A yang berbeda, berkorelasi dengan fitur klinis seperti ukuran tumor dan risiko kekambuhan.

Penelitian juga mengidentifikasi lebih dari 1,300 m6A quantitative trait loci (m6A-QTLs) yang menunjukkan hubungan antara varian genetik dan regulasi m6A. Kurangnya oksigen (hipoksia) dalam mikroenvironment tumor teridentifikasi sebagai faktor utama yang mendorong dis-regulasi m6A, memengaruhi gen terkait proses seluler.

Perubahan pada enzim pengatur m6A sebagai indikator hasil klinis menunjukkan potensi m6A sebagai biomarker prognosis kanker prostat. Alterasi jumlah salinan (CNA) pada gen VIRMA dan YTHDF3 berhubungan dengan tingkat keparahan penyakit dan risiko kekambuhan. Temuan ini menunjukkan bahwa m6A dapat digunakan untuk stratifikasi pasien.

VCAN, gen yang mengkode protein matriks ekstraseluler, ditemukan berperan dalam agresivitas kanker prostat melalui stabilisasi RNA-nya yang dimodifikasi m6A. Penurunan ekspresi VCAN secara signifikan menekan pertumbuhan dan invasi sel kanker. Modifikasi m6A pada RNA VCAN meningkatkan stabilitas dan translasi yang didorong oleh protein IGF2BP.

Secara keseluruhan, penelitian ini menunjukkan bahwa m6A berfungsi ganda sebagai biomarker dan target terapeutik. Memahami regulasi m6A dapat membuka jalan untuk pengobatan baru terhadap kanker prostat yang agresif, memberikan harapan bagi pasien.

Temuan ini menegaskan pentingnya m6A sebagai biomarker dan target terapi dalam kanker prostat. Penelitian ini menunjukkan bahwa lewat modifikasi RNA, m6A tidak hanya mencerminkan biologi penyakit tetapi juga berpengaruh pada hasil klinis seperti kelangsungan hidup dan perkembangan penyakit. Dengan memahami regulasi m6A, ada potensi untuk mengembangkan terapi inovatif bagi pasien kanker prostat agresif.

Sumber Asli: www.insideprecisionmedicine.com